Ghafoor D, Hayakijkosol O, Prasetsincharoen N, Chen CCM, Noman M, Chomchat P, Kinobe R. · Marine environmental research · 2025

Characterisation of the gut microbiome and surveillance of antibiotic resistance genes in green sea turtles (Chelonia mydas).

Resumo em português

As tartarugas-verdes (Chelonia mydas) são herbívoros marinhos globalmente ameaçados que mantêm a saúde dos ecossistemas de ervas marinhas e costeiros. Suas populações estão em declínio devido a atividades humanas, incluindo a poluição ambiental, que pode perturbar as comunidades microbianas intestinais e comprometer a nutrição, imunidade e saúde geral. Neste estudo, swabs cloacais de 139 tartarugas-verdes categorizadas como juvenis cativas, adultos cativos e animais encalhados selvagens no Golfo da Tailândia foram analisados por sequenciamento metagenômico shotgun para elucidar a diversidade taxonômica bacteriana e os perfis de genes de resistência a antibióticos (ARG). Em juvenis cativas, Pseudomonadota foi o filo mais abundante, seguido por Ascomycota e Basidiomycota. Em adultos cativos, Pseudomonadota apresentou predominância ainda maior, com contribuições menores de bactérias não classificadas e outros táxons. Em tartarugas-verdes selvagens encalhadas, Pseudomonadota predominava no microbioma intestinal, porém com níveis notáveis de Actinomycetota, Bacteroidota e Bacillota. As tartarugas encalhadas exibiram maior diversidade e variabilidade microbiana, enquanto os adultos cativos apresentaram a menor. O perfil do resistoma também revelou diferenças significativas na abundância relativa dos genes de resistência a antibióticos entre os três grupos. MacB (resistência a macrolídeos) foi o gene mais abundante no geral, com maior frequência em juvenis (4,8 %). As tartarugas encalhadas exibiram níveis elevados de TetA(58) (resistência a tetraciclina, 2,6 %) e msbA (resistência a nitroimidazol, 2,2 %), enquanto os adultos apresentaram maior enriquecimento de Ecol_fabG_TRC (resistência a triclosan, 3,8 %) e TxR (resistência a tetraciclina, 3,6 %). Estes dados demonstram que há variabilidade marcante no microbioma e no resistoma intestinal de tartarugas-verdes em diferentes estágios de vida, em ambientes cativos ou selvagens. Isso oferece informações críticas para o desenvolvimento de estratégias de conservação direcionadas e práticas de manejo da saúde para tartarugas-verdes selvagens e cativas. Estratégias para mitigar a disseminação da resistência a antibióticos devem ser desenvolvidas.

Resumo original em inglês

Green sea turtles (Chelonia mydas) are globally endangered marine herbivores that maintain the health of seagrass and coastal ecosystems. Their populations are declining due to human activities, including environmental pollution, which can disrupt gut microbial communities and compromise nutrition, immunity, and overall health. In this study, cloacal swabs from 139 green sea turtles categorised as captive juveniles, captive adults and wild stranded animals in the Gulf of Thailand, were analysed via shotgun metagenomic sequencing to elucidate bacterial taxonomic diversity and ARG profiles. In captive juveniles, Pseudomonadota was the most abundant phylum, followed by Ascomycota and Basidiomycota. In captive adults, Pseudomonadota exhibited an even greater predominance, with only minor contributions from unclassified bacteria and other taxa. In wild stranded green sea turtles, Pseudomonadota was dominant in their gut microbiome, but this was accompanied by notable levels of Actinomycetota, Bacteroidota, and Bacillota. Stranded turtles exhibited highest microbial diversity and variability, while captive adult turtles showed the lowest. Resistome profiling also revealed significant differences in the relative abundance of antibiotic resistance genes across all three groups. MacB (macrolide resistance) was the most abundant gene overall, with the highest abundance observed in juveniles (4.8 %). Stranded turtles exhibited elevated levels of TetA(58) (tetracycline resistance, 2.6 %) and msbA (nitroimidazole resistance, 2.2 %), while adults showed the greatest enrichment of Ecol_fabG_TRC (triclosan resistance, 3.8 %) and TxR (tetracycline resistance, 3.6 %). These data demonstrate that marked variability existed in the gut microbiome and resistome of green sea turtles across different life stages in captive or wild environments. This offers critical insights for the development of targeted conservation strategies and health management practices for both wild and captive green sea turtles. Strategies to mitigate the spread of antibiotic resistance should be developed.

Espécies citadas

• Chelonia mydas · tartaruga-verde
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Chelonia mydas.