Kaizer M, Bittencourt PS, Polo ÉM, Sanaiotti TM, Farias IP, von Fersen L, Hrbek T, Banhos A. · Zoo biology · 2025

Development of Microsatellite Markers for Ex Situ Management of the Harpy Eagle Using Next Generation Sequencing.

Resumo em português

O gavião-real (Harpia harpyja), uma das maiores aves de rapina do mundo, está ameaçado de extinção em toda sua área de ocorrência no Neotrópico. Embora os esforços de conservação para as populações selvagens sejam cruciais, também é importante focar em ações de conservação ex situ. Para isso, compreender as características genéticas da população cativa é essencial para evitar endogamia e perda de diversidade genética ao longo do tempo. Neste estudo, utilizamos uma estratégia de sequenciamento de próxima geração para desenvolver um novo conjunto de primers para regiões de microssatélites específicas do gavião-real. Esses marcadores foram validados em indivíduos de gavião-real mantidos em cativeiro em zoológicos e instituições de conservação brasileiras. Caracterizamos esses indivíduos cativos usando dez loci de microssatélites altamente polimórficos para estimar parentesco e identificação individual com mais de 95% de acurácia. O mesmo efeito pode ser alcançado com quatro loci. Adicionalmente, desenvolvemos um teste estatístico para refinar ainda mais as estimativas de relacionamento. Associado a marcadores de sexo robustos, o novo conjunto de marcadores de microssatélites apresentado aqui tem potencial para orientar estratégias de manejo ex situ, visando melhores pareamentos reprodutivos e a manutenção da diversidade genética do gavião-real.

Resumo original em inglês

The Harpy Eagle (Harpia harpyja), one of the largest birds of prey in the world, is threatened with extinction throughout its entire area of occurrence in the Neotropics. While conservation efforts for the wild populations are crucial, it is also important to focus on ex situ conservation actions. To achieve this, understanding the genetic characteristics of the captive population is essential to prevent inbreeding and loss of genetic diversity over time. In this study, we employed a next generation sequencing strategy to develop a new set of primers for microsatellite regions specific to the Harpy Eagle. These markers were validated in Harpy Eagle individuals maintained in captivity at Brazilian zoos and conservation institutions. We characterized these captive individuals using ten highly polymorphic microsatellite loci to estimate relatedness and individual identification at > 95% accuracy. The same effect can be achieved with four loci. Additionally, we developed a statistical test to further refine relationship estimates. Paired with robust sex markers, the new set of microsatellite markers presented here the potential to guide ex situ management strategies, aiming for better reproductive pairings and the maintenance of genetic diversity of the Harpy Eagle.

Espécies citadas

• Harpia harpyja · gavião-real
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Harpia harpyja.