Sung Bin Lee, Byung Yeop Kim, Won Joon Jung, Han Seok Cho, Kevin Cho, Hyemin Kim, Euna Song, Sib Sankar Giri, Su Jin Jo, Mae Hyun Hwang, Jae Hong Park, Da Sol Park, Eun Jae Park, Ihn-Sil Kwak, Se Chang Park · PLoS ONE · 2025

Distribution analysis of the finless porpoises (Neophocaena sp.) and oceanic dolphins (Delphinidae) in the Korean Sea using environmental DNA.

Resumo em português

O DNA ambiental (eDNA) serve como uma ferramenta não invasiva para monitorar a presença de organismos específicos em áreas desafiadoras ou de difícil acesso. Tentamos o monitoramento não invasivo de espécies de cetáceos coreanos ao extrair eDNA dos mares ocidental e meridional da República da Coreia, bem como ao redor da Ilha de Jeju. Neste estudo, focamos em dois cetáceos representativos do Mar da Coreia: o boto-liso-chinês (Neophocaena asiaeorientalis sunameri) e golfinhos oceânicos (família Delphinidae). Ao selecionar os primers para reação em cadeia da polimerase, o DNA mitocondrial (mtDNA) de N. asiaeorientalis e o microssatélite Slo4 de golfinhos oceânicos foram identificados como as sequências gênicas mais eficazes em alta abundância em amostras de eDNA de baixa concentração, utilizando amostras de tecidos para a detecção do eDNA das espécies-alvo. Um total de 139 amostras foi coletado, e eDNA foi detectado de botos-lisos (Neophocaena sp.) em 94 amostras (68%) e de golfinhos oceânicos em 50 amostras (36%). De forma significativa, o eDNA revelou a considerável presença do boto-liso ao redor da Ilha de Jeju, apesar da ausência de confirmação visual. No Mar Amarelo, o eDNA detectou principalmente a presença do golfinho-comum (Delphinus delphis), da orca (Orcinus orca) e do golfinho-nariz-de-garrafa-do-Índico (Tursiops aduncus). Golfinhos-nariz-de-garrafa-do-Índico foram identificados ao longo da costa da Ilha de Jeju. O valor desta pesquisa está em ser a primeira tentativa de explorar o eDNA de cetáceos em diversas espécies na Coreia. Futuras pesquisas sobre eDNA de cetáceos devem focar no desenvolvimento de primers de metabarcoding capazes de detectar uma maior variedade de espécies de cetáceos e primers para detectar espécies específicas de botos. Este estudo servirá como referência valiosa para trabalhos futuros.

Resumo original em inglês

Environmental DNA (eDNA) serves as a non-invasive tool for monitoring the presence of specific organisms in challenging or hard-to-access areas. We attempted non-invasive monitoring of Korean cetacean species by extracting eDNA from the western and southern seas of the Republic of Korea, as well as around Jeju Island. In the present study, we focused on two representative cetaceans of the Korean Sea: the narrow-ridged finless porpoise (Neophocaena asiaeorientalis sunameri) and oceanic dolphins (Family Delphinidae). When selecting polymerase chain reaction primers, mitochondrial DNA (mtDNA) of N. asiaeorientalis and microsatellite Slo4 of oceanic dolphins were identified as the most effective gene sequences in high abundance in low concentration eDNA samples, using tissue samples for eDNA detection of the target species. A total of 139 samples were collected, and eDNA was detected from finless porpoises (Neophocaena sp.) in 94 samples (68%) and from oceanic dolphins in 50 samples (36%). Significantly, eDNA revealed the considerable presence of finless porpoise around Jeju Island, despite a lack of visual confirmation. In the Yellow Sea, eDNA primarily detected the presence of common dolphin (Delphinus delphis), orca (Orcinus orca), and Indo-Pacific bottlenose dolphin (Tursiops aduncus). Indo-Pacific bottlenose dolphins were identified along the coast of Jeju Island. The value of this research lies in being the first attempt to explore cetacean eDNA across various species in Korea. Further cetacean eDNA research should focus on developing metabarcoding primers capable of detecting a greater variety of cetacean species and primers for detecting specific porpoise species. This study will serve as a valuable reference for future studies.

Espécies citadas

• Neophocaena asiaeorientalis · boto-liso-chinês
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Neophocaena asiaeorientalis.
• Tursiops aduncus · golfinho-nariz-de-garrafa-do-Índico
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Tursiops aduncus.
• Delphinus delphis · golfinho-comum
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Delphinus delphis.
• Orcinus orca · orca
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Orcinus orca.