Yan Y, Liu T, He X, Mu M, Yang Z. · Animals : an open access journal from MDPI · 2025

Genome-Wide Identification of MicroRNAs and Immune-Related Proteins Provides Insights into Antiviral Adaptations in Common Vampire Bat.

Resumo em português

Morcegos são reservatórios naturais de diversos vírus, mas raramente desenvolvem doenças, sugerindo adaptações antivirais únicas. Neste estudo, realizamos uma análise genômica abrangente no morcego-vampiro-comum (Desmodus rotundus), integrando genômica comparativa, anotação funcional, descoberta de microRNAs (miRNAs), predição de alvos e análises baseadas em redes. A análise genômica comparativa revelou que Phyllostomus discolor apresenta a maior homologia proteica (97,4%) com D. rotundus. O alinhamento dos fatores reguladores de interferon (IRFs) indicou forte conservação de IRF1, IRF5 e IRF8, enquanto IRF4 e IRF7 mostraram divergência, refletindo modulação específica dos morcegos na sinalização do interferon. A anotação funcional de proteínas previamente não caracterizadas identificou elementos relacionados ao sistema imune, incluindo receptor toll-like 4, sincitina-1 e sequências retrovirais endógenas, destacando a integração de componentes virais na imunidade do hospedeiro. Identificamos ainda 19 miRNAs novos em D. rotundus, com genes alvo de alta confiança como SOD2, TRIM28 e FGFR1, envolvidos na defesa antiviral, regulação da apoptose e resposta ao estresse oxidativo. Análises de enriquecimento funcional revelaram processos associados à cicatrização de feridas, supressão da apoptose, resposta à infecção e longevidade. A análise de entropia da rede destacou núcleos regulatórios centrais, incluindo MYC, BCL2 e KIF1B, que influenciam ciclo celular, sobrevivência e equilíbrio imune. Coletivamente, esses resultados demonstram que D. rotundus emprega uma rede regulatória integrada que combina fatores imunes conservados, divergência gênica específica de linhagem e ajustes mediados por miRNAs para alcançar tolerância viral sem patologia. Este estudo amplia nosso entendimento da biologia antiviral dos morcegos-vampiros e fornece alvos moleculares candidatos para futuras pesquisas funcionais e translacionais.

Resumo original em inglês

Bats are natural reservoirs for diverse viruses, yet they rarely develop disease, suggesting unique antiviral adaptations. In this study, we performed a comprehensive genome-wide analysis in the common vampire bat ( Desmodus rotundus ), integrating comparative genomics, functional annotation, microRNA (miRNA) discovery, target prediction, and network-based analyses. Comparative genomic analysis revealed that Phyllostomus discolor exhibits the highest protein homology (97.4%) with D. rotundus . Alignment of interferon regulatory factors (IRFs) indicated strong conservation of IRF1, IRF5, and IRF8, while IRF4 and IRF7 showed divergence, reflecting bat-specific modulation of interferon signaling. Functional annotation of previously uncharacterized proteins identified immune-related elements, including toll-like receptor 4, syncytin-1, and endogenous retroviral sequences, highlighting the integration of viral components into host immunity. We further identified 19 novel miRNAs in D. rotundus , with high-confidence target genes such as SOD2 , TRIM28 , and FGFR1 involved in antiviral defense, apoptosis regulation, and oxidative stress response. Functional enrichment analyses revealed processes associated with wound healing, apoptosis suppression, infection response, and longevity. Network entropy analysis highlighted central regulatory hubs, including MYC , BCL2 , and KIF1B , influencing cell cycle, survival, and immune balance. Collectively, these results demonstrate that D. rotundus employs an integrated regulatory network combining conserved immune factors, lineage-specific gene divergence, and miRNA-mediated fine-tuning to achieve viral tolerance without pathology. This study expands our understanding of bat antiviral biology and provides candidate molecular targets for future functional and translational research.

Espécies citadas

• Desmodus rotundus · morcego-vampiro
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Desmodus rotundus.