Barbanti A, Pegueroles C, Margaritoulis D, Rees AF, Turkozan O, Ulger C, Snape RTE, Broderick AC, Demetropoulos A, Demetropoulos S, Hamza AA, Levi Y, Pascual M, Carreras C. · 2025

Genomics on a warming sea: structure and adaptation of the Mediterranean loggerhead (Caretta caretta) nesting populations

Resumo em português

RESUMO Considerando o atual cenário de crise da biodiversidade, é crucial compreender como as populações estão estruturadas e seus fatores de adaptação para auxiliar no manejo e conservação. Nesse contexto, prevê-se que as tartarugas marinhas serão fortemente impactadas pelas mudanças climáticas, causando a feminização das populações e a diminuição das taxas de sobrevivência dos filhotes. Esses efeitos podem ser exacerbados no Mediterrâneo, pois prevê-se que o aquecimento global ultrapasse as tendências globais. Aqui, genotipamos 243 indivíduos de 11 populações reprodutoras da tartaruga-cabeçuda (Caretta caretta) do Mediterrâneo usando 2bRAD, obtendo um painel de 5.998 SNPs selecionados. Em seguida, combinamos essas informações genômicas com dados ambientais, comportamentais e reprodutivos para investigar a estrutura populacional e entender seus mecanismos de adaptação. Encontramos diferenciação genética substancial entre quase todas as colônias, com uma grande divisão separando localizações gregas e uma segunda separação isolando a Líbia das localizações levantinas. Essa estrutura genética, causada pela filopatria masculina e feminina, também foi moldada pela adaptação, com fortes sinais genômicos associados a todas as variáveis fenotípicas e ambientais testadas. Uma análise de priorização para conservação, para identificar as áreas com maior prioridade para proteção, concluiu que proteger todas as colônias deve ser considerado prioridade, pois algumas áreas são fundamentais para reter a diversidade genética e o potencial adaptativo da região do Mediterrâneo, enquanto outras desempenham papel crucial na manutenção da conectividade, que é essencial para a sobrevivência a longo prazo desta espécie vulnerável. Este estudo de caso exemplifica o potencial da genômica em revelar informações-chave para espécies sob preocupação conservacionista.

Resumo original em inglês

Abstract Considering the current scenario of biodiversity crisis, it is crucial to understand how populations are structured and their adaptation drivers to aid management and conservation. In this context, sea turtles are predicted to be heavily impacted by climate change, causing feminisation of the populations and decreasing hatchling survival rates. These effects can be exacerbated in the Mediterranean, as it is predicted that global warming will exceed global trends. Here we genotyped 243 individuals from 11 nesting populations of the Mediterranean loggerhead se turtle ( Caretta caretta ) using 2bRAD, obtaining a panel of 5,998 curated SNPS. We then combined this genomic information of with environmental, behavioural and reproductive data to investigate their population structure and understand their mechanisms of adaptation. We found substantial genetic differentiation among almost all rookeries, with a major break separating Greek locations, and a second break separating Libya from the Levantine locations. This genetic structuring, caused by male and female philopatry, was also shaped by adaptation with strong genomic signals associated with all phenotypic and environmental variables tested. A conservation prioritisation analysis, to identify the areas with higher priority for protection, concluded that protecting all rookeries should be considered a priority, as some areas are key to retain the genetic diversity and adaptive potential of the Mediterranean region, while others play a crucial role maintaining connectivity that is fundamental for the long-term survival of this vulnerable species. This case study exemplifies the potential of genomics to unveil key information for species of conservation concern.

Espécies citadas

• Caretta caretta · tartaruga-cabeçuda
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Caretta caretta.