Amber O. Brown, Wendy Noke Durden, Callahan McGovern, Dale A. Casamatta · Scientific Reports · 2026

An exploratory investigation into the microbial and cyanobacterial presence on skin epibiotia and orofacial lesions in estuarine common bottlenose dolphins (Tursiops truncatus) through metabarcoding

Resumo em português

RESUMO Golfinhos-nariz-de-garrafa (Tursiops truncatus) estuarinos habitando a Laguna Indian River (IRL) têm sido documentados com lesões cutâneas acastanhadas, categorizadas genericamente como “camadas de algas”. Nos últimos anos, golfinhos da IRL também apresentaram lesões orofaciais necróticas e ulcerativas incomuns. Até o momento, nenhuma investigação por metabarcoding foi realizada para determinar se as “camadas de algas” observadas nos golfinhos são patogênicas, oportunistas ou indicadoras de pior estado de saúde ou qualidade da água. O objetivo deste estudo foi investigar a etiologia das “camadas de algas” e das lesões orofaciais, para avaliar o potencial patogênico. Neste estudo, 13 amostras de swab de pele e “camada de algas” de 11 golfinhos foram sequenciadas usando técnicas de metabarcoding. A identificação em nível de gênero foi obtida e comparada. Os resultados tanto das amostras de “camada de algas” quanto das lesões orofaciais mostraram maior diversidade bacteriana do que a relatada nos microbiomas cutâneos normais do golfinho-nariz-de-garrafa. Gêneros bacterianos não reportados anteriormente foram identificados, incluindo gêneros que contêm espécies patogênicas presentes em ambos os tipos de amostras. As espécies responsáveis pelas “camadas de algas” não foram definitivamente identificadas. Numerosos gêneros de cianobactérias tipicamente encontrados em condições eutróficas foram identificados.

Resumo original em inglês

Abstract Estuarine common bottlenose dolphins (Tursiops truncatus) inhabiting the Indian River Lagoon (IRL) have been documented with light brown skin lesions, loosely categorized as “algal sheens”. In recent years, dolphins from the IRL have also exhibited unusual necro-ulcerative orofacial lesions. To date, no metabarcoding investigation has been conducted to determine whether “algal sheens” observed on the dolphins are pathogenic, opportunistic or are indicators of poor health or water quality. The aim of this study was to investigate the etiology of “algal sheens” and orofacial lesions, to assess the pathogenic potential. In this study, 13 skin and “algal sheen” swabs from 11 dolphins were sequenced using metabarcoding techniques. Genus-level identification was achieved and compared. Results from both “algal sheen” and orofacial lesion samples demonstrated higher bacterial diversity than reported in normal bottlenose dolphin skin microbiomes. Previously unreported bacterial genera were identified, genera containing pathogenic species found in both sample types. Species responsible for “algal sheens” were not definitively identified. Numerous cyanobacterial genera typically found in eutrophic conditions were identified.

Espécies citadas

• Tursiops truncatus · golfinho-nariz-de-garrafa
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Tursiops truncatus.