Montes-Carreto LM, Arellano-Hernández HD, Guerrero JA, Martinez-Romero E. · PloS one · 2026

Comparative fecal microbiome analysis of the endangered Volcano rabbit (Romerolagus diazi) reveals a microbial core in contrasting habitats of Central Mexico.

Resumo em português

Herbívoros apresentam maior diversidade microbiana em seus tratos digestivos do que onívoros ou carnívoros. Simbiontes bacterianos ampliam a capacidade digestiva do hospedeiro ao fermentar celulose e hemicelulose. Comparações entre populações em diferentes áreas de distribuição podem revelar como condições ambientais afetam a microbiota, auxiliando no planejamento de estratégias de conservação. O coelho-do-volcán (Romerolagus diazi) é o menor lagomorfo do México. É classificado como ameaçado pela legislação mexicana e como criticamente ameaçado pela IUCN, na Lista Vermelha. Aqui expandimos nosso estudo prévio do microbioma para outra região do México, de um sítio alto próximo a um vulcão ativo, o Popocatépetl. Em ambas as áreas, os gêneros bacterianos mais abundantes incluíram Acinetobacter, Enterobacter, Streptomyces, Bacteroides, Pseudomonas, Janthinobacterium, Flavobacterium e Duganella. Entre Archaea, Methanosarcina, Halobaculum, Thermococcus, Halorubrum e Methanobrevibacter foram prevalentes. Gêneros fúngicos como Fusarium, Ascochyta, Pyricularia, Aspergillus e Colletotrichum também foram identificados. Funções potenciais foram identificadas, incluindo metabolismo de carboidratos, aminoácidos e nucleotídeos. As enzimas mais abundantes foram transferases, hidrolases e oxidorredutases. O teste PERMANOVA entre áreas para Bactérias (p = 0,26), Archaea (p = 0,21) e Fungos (p = 0,48) indicou ausência de diferenças significativas na composição taxonômica ou em sequências codificantes (p = 0,5), embora houvesse diferenças em abundâncias relativas. Além disso, para as archaea, gêneros não reportados anteriormente no microbioma fecal do coelho-do-volcán, como Halomicroarcula, Halomicrobium, Haloplanus e Sulfolobus, foram identificados, sendo Sulfolobus exclusivo da região Izta-Popo. O microbioma fecal do coelho-do-volcán apresentou perfis bacterianos e arqueanos únicos. De modo geral, essas comunidades microbianas provavelmente contribuem para a digestão de fibras vegetais, compostos fenólicos e outros componentes dietéticos, ressaltando sua importância para a saúde e conservação dessas espécies ameaçadas.

Resumo original em inglês

Herbivores show a larger microbial diversity in their guts than omnivores or carnivores. Bacterial symbionts expand the host digestion capacity by fermenting cellulose and hemicellulose. Comparisons between populations in different distribution areas can reveal how environmental conditions affect microbiota, helping to design conservation strategies. The Volcano rabbit (Romerolagus diazi) is the smallest lagomorph in Mexico. It is classified as endangered by Mexican legislation and as critically endangered by the IUCN, in the Red List. Here we extend our previous microbiome study to another region in Mexico from a high site near an active volcano, the Popocatépetl. In both areas, the most abundant bacterial genera included Acinetobacter, Enterobacter, Streptomyces, Bacteroides, Pseudomonas, Janthinobacterium, Flavobacterium, and Duganella. Among Archaea, Methanosarcina, Halobaculum, Thermococcus, Halorubrum, and Methanobrevibacter were prevalent. Fungal genera such as Fusarium, Ascochyta, Pyricularia, Aspergillus, and Colletotrichum were also identified. Potential functions were identified including carbohydrate, amino acid and nucleotide metabolism. The most abundant enzymes were transferases, hydrolases and oxidoreductases. The PERMANOVA test between areas for Bacteria (p = 0.26), Archaea (p = 0.21) and Fungi (p = 0.48) indicated no significant differences in the taxonomic composition or coding sequences (p = 0.5), although there were differences in relative abundances. Additionally, for archaea, genera that had not been reported previously in Volcano rabbit fecal microbiomes such as Halomicroarcula, Halomicrobium, Haloplanus, and Sulfolobus were identified, with Sulfolobus found exclusive in Izta-Popo. The Volcano rabbit fecal microbiome showed unique bacterial and archaeal profiles. Overall, these microbial communities are likely to contribute to the digestion of plant fibers, phenolic compounds, and other dietary components, underscoring their importance for the health and conservation of these endangered species.

Espécies citadas

• Romerolagus diazi · coelho-dos-vulcões
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  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Romerolagus diazi.