Freitas JLS, Peres PHF, Grotta-Neto F, Oliveira ML, Duarte JMB. · Animal genetics · 2026

Fecal DNA Identifies a Disjunct Population of an Endemic Deer (Mazama jucunda) From the Atlantic Forest, Brazil.

Resumo em português

O conhecimento limitado sobre a distribuição dos veados-catingueiros persiste devido ao seu comportamento evasivo e às semelhanças morfológicas entre as espécies. Uma população de veado-catingueiro-pardo (gênero Mazama) foi recentemente descoberta no Parque Estadual do Rio Doce (PERD), uma área protegida dentro da Mata Atlântica brasileira; contudo, a identificação ao nível de espécie estava ausente. Considerando que duas espécies endêmicas e ameaçadas de veado-catingueiro-pardo habitam esse bioma, nosso objetivo foi identificar a espécie presente no PERD por meio de análises de DNA fecal. Sequenciamos seis regiões do DNA mitocondrial (1450 pb) a partir de amostras fecais coletadas no PERD e em outros locais da Mata Atlântica, analisando-as em comparação com espécimes de referência. Realizamos análises filogenéticas e utilizamos métodos de delimitação molecular de espécies baseados em coalescência (GMYC e bPTP) para definir unidades taxonômicas moleculares operacionais (MOTUs). Além disso, construímos uma rede de haplótipos e uma matriz de distâncias genéticas. Nossas análises vinculam as amostras do PERD a Mazama jucunda (veado-catingueiro-pardo-pequeno), mas revelaram uma topologia recíproca monofilética, identificando duas MOTUs distintas. O PERD abriga haplótipos únicos, e sua distância genética para M. jucunda é comparável à existente entre M. jucunda e M. nana (veado-catingueiro-anão). Propomos que o PERD hospede uma unidade evolutivamente significativa (ESU) de M. jucunda, localizada a 700 km da sua área conhecida. A estrutura genética observada e o isolamento do PERD apoiam a hipótese de uma possível nova espécie de veado-catingueiro-pardo, o que justifica investigações citogenéticas adicionais. Este estudo representa um avanço significativo na compreensão da distribuição e estrutura genética de um veado ameaçado das florestas neotropicais e apresenta implicações imediatas para a conservação em um dos hotspots de biodiversidade mais degradados do mundo.

Resumo original em inglês

Limited knowledge of brocket deer distribution persists due to their elusive behavior and the morphological similarities among species. A population of red brocket deer (genus Mazama) was recently discovered in the Rio Doce State Park (PERD), a protected area within the Brazilian Atlantic Forest; however, species-level identification was lacking. Given that two endemic and threatened red brocket species inhabit this biome, we aimed to identify the species present in PERD using fecal DNA analyses. We sequenced six mitochondrial DNA regions (1450 bp) from fecal samples collected in PERD and other Atlantic Forest sites, analyzing them against reference specimens. We conducted phylogenetic analyses and employed coalescent-based molecular species delimitation methods (GMYC and bPTP) to define molecular operational taxonomic units (MOTUs). Additionally, we constructed a haplotype network and a genetic distance matrix. Our analyses linked the PERD samples to Mazama jucunda (small red brocket) but revealed a reciprocally monophyletic topology, identifying two distinct MOTUs. PERD harbors unique haplotypes, and its genetic distance to M. jucunda is comparable to that between M. jucunda and M. nana (Brazilian dwarf brocket). We propose that PERD hosts an evolutionarily significant unit (ESU) of M. jucunda, located 700 km from its known range. The observed genetic structure and PERD's isolation support the hypothesis of a potentially new red brocket species, warranting further cytogenetic investigation. This study represents a significant advancement in understanding the distribution and genetic structure of a threatened Neotropical forest deer and has immediate conservation implications in one of the world's most degraded biodiversity hotspots.