Mitogenomic and Metabarcoding Resources for the Study and Conservation of Keystone Neotropical Raptors.
Resumo em português
Os gaviões-neotropicais estão entre as aves mais ameaçadas, enfrentando riscos crescentes de extinção devido à perda de habitat e à perseguição humana. Apesar de sua importância para a estabilidade dos ecossistemas, dados básicos sobre sua distribuição, abundância e diversidade genética ainda são escassos. Para suprir essas lacunas, montamos e anotamos os genomas mitocondriais de nove gaviões prioritários dos Neotrópicos, incluindo o ameaçado bútio-do-chaco (Buteogallus coronatus), a águia-gavião-bicolor (Spizaetus isidori), o bútio-patagónico (Buteo ventralis) e o gavião-real (Harpia harpyja), assim como o falcão-de-peito-laranja (Falco deiroleucus), a águia-de-crista (Morphnus guianensis), a águia-gavião-coroada (Spizaetus ornatus), o bútio-plúmbeo (Cryptoleucopteryx plumbea) e o bútio-solitário (Buteogallus solitarius). Os tamanhos dos mitogenomas variaram de 17.848 a 20.449 pb, com conteúdo gênico consistente e uma arquitetura da Região de Controle comum em Falconidae e Accipitridae. Análises filogenéticas forneceram forte suporte para a maioria das relações, destacando o valor dos dados mitogenômicos para estudos filogeográficos. Além disso, desenhamos primers para metabarcoding destinados a aplicações com DNA ambiental. Primers que visam o gene 12S rRNA e um mini-código de barras da Região de Controle do gavião-real mostraram alta resolução usando sequências curtas e conservadas, ideais para combinar DNA degradado com sequenciamento de próxima geração. Nosso estudo oferece ferramentas moleculares essenciais para o monitoramento e a proteção desses gaviões ecologicamente vitais e ameaçados nas Américas.
Resumo original em inglês
Neotropical raptors are among the most threatened birds, facing increasing extinction risks due to habitat loss and human persecution. Despite their importance for ecosystem stability, basic data on their distribution, abundance, and genetic diversity remain scarce. To address these gaps, we assembled and annotated the mitochondrial genomes of nine high-priority raptors from the Neotropics, including the threatened Chaco Eagle ( Buteogallus coronatus ), Black-and-Chestnut Eagle ( Spizaetus isidori ), Rufous-tailed Hawk ( Buteo ventralis ), and Harpy Eagle ( Harpia harpyja ), as well as the Near Threatened Orange-breasted Falcon ( Falco deiroleucus ), Crested Eagle ( Morphnus guianensis ), Ornate Hawk-Eagle ( Spizaetus ornatus ), Plumbeous Hawk ( Cryptoleucopteryx plumbea ), and Solitary Eagle ( Buteogallus solitarius ). Mitogenome sizes ranged from 17,848 to 20,449 bp, with consistent gene content and a Control Region architecture common in Falconidae and Accipitridae. Phylogenetic analyses provided strong support for most relationships, highlighting the value of mitogenomic data for phylogeographic studies. We further designed metabarcoding primers for environmental DNA applications. Primers targeting the 12S rRNA gene and a mini-barcode for the Harpy Eagle's Control Region showed high resolution using short, conserved sequences ideal for combining degraded DNA with next-generation sequencing. Our study provides essential molecular tools for monitoring and protecting these ecologically vital yet threatened raptors across the Americas.
Espécies citadas
- Harpia harpyja · gavião-real
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Harpia harpyja. - Buteo ventralis · bútio-patagónico
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Buteo ventralis. - Buteogallus coronatus · bútio-do-chaco
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Buteogallus coronatus. - Buteogallus solitarius · bútio-solitário
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Buteogallus solitarius. - Cryptoleucopteryx plumbea · bútio-plúmbeo
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Cryptoleucopteryx plumbea. - Falco deiroleucus · falcão-de-peito-laranja
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Falco deiroleucus. - Morphnus guianensis · águia-de-crista
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Morphnus guianensis. - Spizaetus isidori · águia-gavião-bicolor
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Spizaetus isidori. - Spizaetus ornatus · águia-gavião-coroada
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Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Spizaetus ornatus.
Fonte e licença. Publicado sob CC BY. DOI: 10.1002/ece3.73262. Ler o artigo completo na fonte ↗
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Dados de terceiros. Metadados bibliográficos do Europe PMC, DOAJ, Crossref e OpenAlex. Taxonomia do GBIF — Global Biodiversity Information Facility, Backbone Taxonomy sob CC BY 4.0.
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