da Silva DF, de Sousa RPC, Bessa-Silva A, Gomes GFE, Vallinoto M, Sampaio I. · Primates; journal of primatology · 2026

Revisiting the relationships among howler monkeys through molecular phylogenetic analysis (Primates; Atelidae; Alouatta).

Resumo em português

Os bugios (Alouatta) fazem parte da infraordem Platyrrhini, um grupo de primatas neotropicais com a mais ampla distribuição geográfica, ocorrendo do sul do México ao norte da Argentina. Estudos filogenéticos anteriores baseados em dados citogenéticos, morfológicos e moleculares mostraram resultados inconsistentes, demandando novas abordagens para esclarecer as relações dentro do gênero. Neste estudo, analisamos nove espécies de bugios (Alouatta) usando 24 marcadores moleculares (2 genes mitocondriais e 22 genes nucleares). Por meio de inferência bayesiana, máxima verossimilhança e análises de tempo de divergência, inferimos a filogenia e estimamos o momento dos eventos de especiação. Nossos resultados recuperaram dois grandes clados dentro de Alouatta, correspondendo às linhagens mesoamericanas (trans-andinas) e sul-americanas (cis-andinas). A maior parte dos eventos de diversificação ocorreu durante o Plioceno. Dentro do clado sul-americano, identificamos dois grupos bem suportados: um composto por espécies da Mata Atlântica e da Amazônia oriental (A. guariba, A. belzebul e A. discolor), provavelmente moldado pela formação da diagonal seca da América do Sul; e outro formado por A. caraya e pelo complexo A. seniculus. Notavelmente, nossos resultados confirmaram uma relação filogenética próxima entre A. discolor e A. belzebul, e entre A. macconnelli e A. nigerrima, que ocorrem em lados opostos do rio Amazonas. Essas relações, junto com a confirmação de A. discolor e A. nigerrima como espécies distintas com base em evidências multilocus de localidades conhecidas, representam avanços em relação a estudos anteriores e contribuem para um entendimento mais resolvido da diversificação dos bugios (Alouatta).

Resumo original em inglês

The howler monkeys (Alouatta) are part of the Platyrrhini infraorder, a group of Neotropical primates with the widest geographical distribution, occurring from southern Mexico to northern Argentina. Previous phylogenetic studies based on cytogenetic, morphological, and molecular data have shown inconsistent results, requiring new approaches to clarify relationships within the genus. In this study, we analyzed nine species of Alouatta using 24 molecular markers (2 mitochondrial and 22 nuclear genes). Through Bayesian inference, Maximum Likelihood, and divergence time analyses, we inferred the phylogeny and estimated the timing of speciation events. Our results recovered two major clades within Alouatta, corresponding to Mesoamerican (Trans-Andean) and South American (Cis-Andean) lineages. Most diversification events occurred during the Pliocene. Within the South American clade, we identified two well-supported groups: one composed of species from the Atlantic Forest and eastern Amazon (A. guariba, A. belzebul, and A. discolor), likely shaped by the formation of the South American dry diagonal; and another formed by A. caraya and the A. seniculus complex. Notably, our results confirmed a close phylogenetic relationship between A. discolor and A. belzebul, and between A. macconnelli and A. nigerrima, which occur on opposite sides of the Amazon River.These relationships, along with the confirmation of A. discolor and A. nigerrima as distinct species based on multilocus evidence from known localities, represent advances over previous studies and contribute to a more resolved understanding of Alouatta diversification.