Kaitlyn Romoser, Shizuka Hashimoto, Nasrah M C Hamdan, Leonardo Sena, Miriam Marmontel, Tomas Hrbek, Izeni P Farias, Kirk O Winemiller · PLoS ONE · 2026

Survey of vulnerable Amazonian manatees using environmental DNA (eDNA): A method for survey in remote field settings.

Resumo em português

A única linhagem exclusivamente de água doce de Sirenia, o peixe-boi amazónico (Trichechus inunguis), está listado pela IUCN como vulnerável, com populações projetadas para declinar ainda mais nas próximas décadas. Considerando que a caça ilegal, poluição, distúrbios no habitat e outros impactos continuam, é imperativo avaliar a distribuição e abundância deste mamífero aquático único e elusivo. Neste estudo, utilizamos métodos de DNA ambiental (eDNA) para testar a presença de T. inunguis em três localidades ao longo do gradiente longitudinal do rio Amazonas e seus afluentes (Tefé, Manaus, Belém). Em cada local, amostras de água foram coletadas em sítios que abrangem um gradiente de distúrbio, desde áreas urbanas até reservas protegidas. Desenvolvemos uma metodologia de campo para preservar DNA por até 13 dias ou mais sem necessidade de congelamento ou refrigeração das amostras. Este método apresentou desempenho semelhante aos métodos tradicionais de armazenamento a frio usados na pesquisa de eDNA. No laboratório, o DNA foi extraído das amostras, seguido pela amplificação por PCR e sequenciamento Illumina. A detecção de DNA do peixe-boi amazónico foi mais de três vezes maior na Amazônia ocidental (Tefé e Reserva Mamirauá), onde a atividade humana é baixa. O DNA do peixe-boi foi detectado em seis sítios na Amazônia central (Manaus) e em apenas dois sítios na Amazônia oriental, próximo à costa (Belém), onde as populações humanas e os impactos são maiores. A metodologia de eDNA foi eficaz para detectar peixes-bois e espera-se que seja útil para estimar sua distribuição mais ampla, bem como para monitorar outras espécies aquáticas em rios tropicais.

Resumo original em inglês

The only exclusively freshwater lineage of Sirenia, the Amazonian manatee (Trichechus inunguis) is listed by the IUCN as vulnerable, with populations projected to decline further during the coming decades. Given that illegal hunting, pollution, habitat disturbance and other impacts are ongoing, it is imperative to assess the distribution and abundance of this unique, elusive aquatic mammal. In this study, we used environmental DNA (eDNA) methods to test for T. inunguis presence at three locations along the longitudinal gradient of the Amazon River and its tributaries (Tefé, Manaus, Belém). At each location, water samples were collected at sites spanning a disturbance gradient from urban to protected reserves. We developed a field methodology to preserve DNA for up to 13 days or more without requiring freezing or cooling of samples. This method performed similarly to traditional cold-storage methods used for eDNA research. In the lab, DNA was extracted from the samples followed by PCR amplification, and Illumina sequencing. Detection of Amazonian manatee DNA was more than three times greater in the western Amazon (Tefé and Mamirauá Reserve) where human activity is low. Manatee DNA was detected at six sites in the central Amazon (Manaus) and in only two sites in the eastern Amazon near the coast (Belém) where human populations and impacts are greater. eDNA methodology was effective for detecting manatees and is expected to be useful for estimating their broader distribution as well as surveying other aquatic species in tropical rivers.

Espécies citadas

• Trichechus inunguis · peixe-boi amazónico
  ?

  Nomes populares variam entre regiões e uma mesma palavra pode designar espécies diferentes. Confira sempre o nome científico: Trichechus inunguis.