Tigano A, Herder EC, Long K, Supernault J, Curtis DL, Hansen SC, Mazur MD, Rondeau EB, Bureau D. · Evolutionary applications · 2026

Whole Genome Analyses of the Endangered Northern Abalone (<i>Haliotis kamtschatkana</i>) Reveal Population Differentiation and a Genomic Signature of a Dramatic Population Decline.

Resumo em português

Apesar do declínio generalizado de muitas espécies da vida selvagem, os efeitos do declínio populacional no genoma e o potencial de recuperação das espécies afetadas ainda são pouco compreendidos, especialmente além de algumas espécies carismáticas. O abalone-do-norte (ou abalone-pinto; Haliotis kamtschatkana) é um molusco gastrópode marinho de importância social, cultural e econômica histórica no Noroeste do Pacífico da América do Norte, que sofreu uma queda na densidade populacional devido à exploração comercial, estando atualmente listado como ameaçado no Canadá sob a Lei de Espécies em Risco. Investigações genéticas anteriores baseadas em microssatélites e abordagens de representação reduzida concluíram que o abalone-do-norte é panmíctico ao longo de sua distribuição, do Alasca à Califórnia, e identificaram altos níveis de variação genética sem indicação de declínio populacional. Usando dados de reseqüenciamento de genoma completo de abalone-do-norte coletados ao longo da parte norte da distribuição da espécie, nós, por outro lado, identificamos: (1) diferenciação significativa entre dois grupos genéticos, embora concentrada em poucas regiões genômicas, e (2) uma forte assinatura de um declínio populacional dramático, sem evidências genômicas de endogamia genética. Reconstruções demográficas mostraram um sinal modesto de expansão populacional recente, apoiado pelo aumento do número de juvenis observados durante pesquisas subaquáticas. Também encontramos evidências de conectividade histórica, em vez de atual, na área investigada. Estes resultados são importantes para decisões de manejo e destacam a utilidade dos dados de genoma completo na conservação, especialmente em espécies com historicamente grandes tamanhos efetivos de população, como o abalone-do-norte.

Resumo original em inglês

Despite widespread declines of many wildlife species, the effects of population decline on the genome and the recovery potential of affected species are still poorly understood, especially beyond a few charismatic species. The Northern abalone (or Pinto abalone; Haliotis kamtschatkana ) is a marine gastropod mollusk of social, cultural and historical economic importance in the Pacific Northwest of North America that experienced a decline in population density due to commercial harvest, and is currently listed as endangered in Canada under the Species at Risk Act. Previous genetic investigations based on microsatellites and reduced-representation approaches concluded that Northern abalone is panmictic throughout its range, from Alaska to California, and identified high levels of genetic variation with no indication of population decline. Using whole genome resequencing data from Northern abalone sampled across the northern part of the species range, we instead identified both: (1) significant differentiation between two genetic groups, albeit concentrated in few genomic regions, and (2) a strong signature of a dramatic population decline, without genomic evidence of genetic inbreeding. Demographic reconstructions showed a modest signal of recent population expansion, supported by an increasing number of juveniles observed during dive surveys. We also found evidence of historical, rather than current, connectivity throughout the area investigated. These results are important for management decisions and highlight the utility of whole genome data in conservation, especially in species with historically large effective population sizes like the Northern abalone.